Infekcje żołądkowo-jelitowe mogą być wywoływane przez bakterie, wirusy oraz pasożyty i należą do najczęstszych chorób zakaźnych. Objawiają się one nieżytem żołądka, biegunką, wymiotami lub niespecyficznymi objawami, które mogą pojawić się nawet w ciągu kilku godzin po kontakcie z patogennymi bakteriami lub wirusami i mogą w niektórych przypadkach prowadzić do przewlekłych następstw. Z kolei infekcje pasożytnicze mają zwykle przebieg przewlekły.
Infekcje wirusowe często ustępują samoistnie, dlatego ich leczenie jest zwykle objawowe, a laboratoryjne badania diagnostyczne zwykle nie są wykonywane. Natomiast bakterie, takie jak Yersinia spp. i Campylobacter spp., mogą wywoływać wtórne choroby o podłożu immunologicznym, m.in. reaktywne zapalenie stawów. W tych przypadkach testy serologiczne mogą wspierać diagnozę. Zakażenia Helicobacter pylori mogą powodować przewlekłe aktywne zapalenie żołądka i powikłania, takie jak choroba wrzodowa żołądka i dwunastnicy czy rak żołądka. Wykrywanie przeciwciał jest zalecane w przypadku podejrzenia nieostrej lub przewlekłej infekcji. Patogeny pasożytnicze, takie jak Schistosoma i Strongyloides stercoralis, mogą również powodować objawy żołądkowo-jelitowe o przewlekłym przebiegu. Do diagnostyki stosuje się metody bezpośrednie i pośrednie. Zazwyczaj wykrywanie specyficznych przeciwciał jest odpowiednie do wspomagania diagnozy w przypadku podejrzenia przebiegu przewlekłego lub wtórnych chorób, ale nie jest zalecane do diagnostyki ostrych infekcji.
